Les microorganismes chimioorganotrophes doivent trouver des substances organiques pour pouvoir se développer. Selon leurs possibilités métaboliques, ils vont s'adapter au milieu et en être dépendants. Selon la nature de cette dépendance, on peut distinguer deux grandes catégories de microorganismes chimioorganotrophes

• Les Symbiotiques
• Les Saprophytes

LA SYMBIOSE

La symbiose est une association entre une bactérie et un hôte qui lui fournit "abri et nourriture". C'est une association nécessaire à la survie de l'un des organismes ou les deux.

La symbiose peut prendre deux formes :

• le mutualisme
• le parasitisme

Le Mutualisme

Le mutualisme est une "coopération" entre deux individus. L'exemple choisi est celui des ruminants qui abritent des microorganismes capables de dégrader la cellulose.

Les ruminants consomment des végétaux que les bactéries dégradent parce qu'elles possèdent des enzymes. Cette association a développé au cours de l'évolution des modifications du tube digestif. L'estomac s'est compartimenté. Dans un premier compartiment, les bactéries et les protozoaires peuvent dégrader la cellulose. Les fourrages sont transformés en acides gras et gaz. Les acides gras sont absorbés et fournissent l'énergie. Les bactéries tirent de cette fermentation le carbone et l'énergie.

Par les enzymes plus loin dans le tube digestif, les bactéries sont détruites et leurs protéines et leurs vitamines servent à l'animal.

Le parasitisme

Le parasitisme est une "association" où seul un des deux membres tire parti de la mise en commun. ces relations sont dites parasitaires. Deux groupes existent :

• Les microorganisme commensaux
• Les microorganismes pathogènes

Les microorganismes commensaux

Le commensalisme est une "relation" qui profite à l'un sans bénéfice, ni dommage pour l'autre. Chez les animaux et l'homme de nombreuses espèces microbiennes se développent au contact de la peau et des muqueuses. Ces parasites constituent la flore commensale ou flore normale. Ils ne sont pas indispensables à l'hôte qui les abrite. Mais ils présentent des avantages pour l'hôte car ils stimulent certaines activités physiologiques et empêchent le développement d'autres espèces éventuellement pathogènes.

Les microorganismes pathogènes

Certaines espèces peuvent provoquer des préjudices pour l'hôte qui les abrite. Les microorganismes pathogènes détruisent les tissus ou altèrent les acitivités physiologiques fondamentales

Dans certaines conditions (fatigue, stress...) les bactéries commensales peuvent devenir pathogènes et il y a rupture d'un équilibre.

LE SAPROPHYTISME

Les Saprophytes tirent leurs éléments nutritifs des matières organiques provenant des cadavres animaux et de résidus végétaux. Ils n'établissent donc pas de liens nutritifs avec d'autres êtres vivants

"Les Bons"

Ces microorganismes se rencontrent dans les milieux naturels. Ils constituent la flore majeure de l'eau et du sol. Ils jouent un rôle fondamental en écologie car ils assurent la minéralisation de la matière organique et restituent les éléments minéraux nécessaires à la croissance des organismes autotrophes.

"Les Méchants"

• Certains saprophytes qui vivent dans le sol sont loin d'être inoffensifs.
• Exemple Clostridium tetani qui vit dans le sol provoque le "tétanos".

Relations des Saprophytes avec les autres êtres vivants :

Dans un écosystème, une espèce microbienne ne vit jamais seule. Elle partage cet environnement avec d'autres espèces microbiennes, des animaux, des végétaux. Il s'établit des inter-relations complexes qui influencent le développement des microorganismes.

TABLEAU RECAPITULATIF